（一）在华东公安部
1950年3月17日，原华东局社会部撤销，华东军政委员会公安部成立，李士英调任华东军政委员会公安部部长，王范任副部长。3月21日，李士英主持召开了华东地区公安工作会议，会议制定了华东地区反特、剿匪等10项工作任务，陈毅市长和华东局有关领导到会讲话。
溃逃台湾的国民党政权一直不甘心失败，一面出动飞机到上海、南京等江浙沿海城市进行狂轰滥炸，一面指挥盘踞在浙江、福建沿海岛屿和台湾的残兵败将对大陆 记的通知
进行骚扰破坏。1950年6月朝鲜战争爆发，蒋介石更是认为反攻大陆的机会已到，便大量派遣特务，勾结残留在大陆的国民党势力，妄图“光复大陆”。此时，华东地区反革命分子的破坏活动明显增多，严重威胁着刚刚诞生的人民政权和广大人民群众的生命财产安全。为巩固人民政权，党中央决定在全国开展镇压反革命运动。
1950年3月，中共中央发出《关于镇压反革命的指示》，刚刚调任华东军政委员会公安部的李士英担负起领导华东地区广大公安干警开展镇压反革命的使命。为全面掌握华东地区敌情分布情况，李士英上任后做的第一件事，就是深入开展调查研究，收集华东地区敌情资料，并将有关情况整理汇编后，提供给各级公安机关作为镇反行动部署的依据。
皖南区党委社会部部长兼公安局长苏毅然回忆，1950年春他汇报工作时，李士英对他说：“当前各地区恶霸、土匪和特务反革命串通一气，活动非常猖獗，我们的中心任务只能是肃匪、反霸、镇压反革命。要放手发动群众，坚决镇压反革命和地方上的恶霸及土匪头子。只有坚决把这三股恶势力镇压下去，广大群众才能真心诚意地跟我们党走，社会才能安定下来，治安保卫工作才能有坚实的基础。”
按照中央指示精神，华东地区结合农村土地改革，开展了反对恶霸地主运动，在城市逮捕了一批反动分子，公开处决了为首的反革命分子。在多个城市开展了反动党团分子的登记工作，通过警告、检举等上下结合的方式，迫使原国民党特务机关人员及国民党、三青团骨干分子主动交代身份。镇压反革命运动开始几个月，华东各地就破获案件近千起。
针对镇压反革命运动中出现的问题，1950年10月10日，党中央发出《关于镇压反革命活动的指示》（简称《双十指示》），指示提出：必须坚决肃清一切危害人民的土匪、特务、恶霸及其他反革命分子，同时指出在镇压反革命的问题上各级政府要克服“宽大无边，严重右的偏向”。公安部召开了第二次全国公安工作会议，传达《双十指示》。各大行政区纷纷行动。
华东地区组织实施了镇压反革命分子的统一行动。在山东济南、青岛等地的公安机关，4月1日采取统一行动，逮捕了近干名反革命分子。装着上海、南京、杭州等16个城市和地区，于4月27日至28日也统一进行了大规模逮捕反革命分子行动。华东各省、市、区党委、政府分别组织召开了各界人民代表会议，并成立了“反革命案件审查委员会”，吸收党外民主人士参加案件审理。通过召开控诉大会或公审、公判大会，对罪大恶极、民愤极大的反革命分子，由受害群众到会揭发控诉，公开进行宣判、处决。这种形式极大地教育了广大人民群众，震慑了反动势力，引起各界人士强烈反响。
1951年5月10日，李士英参加了公安部召开的第三次全国公安工作会议。
6月初，李士英主持召开了华东地区公安工作会议，传达了第三次全国公安会议精神，讨论贯彻全国公安会议决议。接着，李士英又主持召开了华东公安部部务会议，决定派出镇反工作检查组，分赴华东各省、区、市检查镇反工作。对检查中发现的问题，及时提出纠正。
在各级党委领导下，经过华东广大公安干警的努力，第三次全国公i议确定的各项工作任务得到了全面贯彻和落实，华东地区镇压反’运动发展得比较顺利。
李士英针对华东地区公安干部大量缺少的情况，提出要办校，办；班，分批轮训在职的公安干部。经中央公安部和华东军政委员会：，华东公安干部学校开始筹建，李士英亲自兼校长。在华东公安部！求下，华东各省和主要地区，也开办了公安干部学校，为华东地区！了大批公安保卫干部。
（二）山东任上
1951年11月，李士英被调到中共山东分局工作，任山东分局委员。同年12月，华东局任命李士英为华东公安部副部长兼山东省公安厅厅长。山东是李士英曾经工作和战斗过的地方，许多干部他都很熟悉。
一到山东，他立即投入到全省正在开展的镇压反革命及“三反五反”运动中。1952年8月，李士英担任了山东省政法委员会主任。10月，根据公安部第五次公安工作会议精神，在全省开展第三阶段镇压反革命分子的部署。全省先后取缔和清除了“圣母军”、“山东民众救国团”和“济南特别潜伏站”等反动教会和组织。
截至1953年底，新中国通过连续大规模的镇反运动，基本上肃清了社会上残余的反革命势力，发动和教育了广大群众，为全国土地改革、抗美援朝和社会经济建设的恢复，为即将到来的社会主义经济建设高潮奠定了坚实的基础。
1952年10月26日，李士英接到公安部罗瑞卿部长电话，通知说中央一位负责同志要到山东来视察。10月25日，山东省军区司令员许世友和李士英到济南火车站迎接。火车进站停稳后，他们看到罗瑞卿下了火车，一问才知道是毛泽东来了。毛泽东在山东期间，先后视察了济南、曲阜、徐州（当时属山东省管辖）等地区，后又赴河南视察。陪同毛泽东视察的有罗瑞卿、杨尚昆等中央领导和山东省军区司令员许世友及山东省的领导同志。期间，李士英负责安全保卫工作。他细致、周密地部署了安全措施，并全程陪同做好警卫工作。
1952年秋，王云也调到山东工作，先后任山东分局妇委副书记、书记、省委候补委员、山东省妇联主席（党组书记）。
1953年3月，山东省人民政府成立。同年12月，李士英被任命为山东省人民政府副主席，中共山东分局纪律检查委员会第二书记。1954年4月，李士英担任中共中央监察委员会委员。8月，陈毅主持召开了中共山东省第一次党员代表大会，会议宣布撤销山东分局，成立了中共山东省委员会。在全省第一次党员代表大会和省委第一次全体会议上，选举舒同担任省委第一书记，谭启龙任第二书记，李士英为省委副书记。
李士英在山东工作期间，虽然担任了省级领导职务，生活上却一贯俭朴。曾担任过李士英秘书的周子明回忆道：“当时，他在公安厅工作，和同志们一起都住在济南的徐家花园（省公安厅内）。同志们常看到他吃饭很简单，剩饭剩菜从不丢弃，加热后再吃。秘书考虑他工作太劳累，就和司务处商量适当改善他的伙食，每星期供应一只母鸡增加营养。他知道后很生气，批评了秘书，并叫如数交钱。秘书解释说：‘同志们都知道你解放前坐过国民党的监牢，受过伤，这是大家对你的关心’。他却说：‘我虽坐过牢，受过伤，可比起牺牲的同志们又算得了什么？同志们关心我，我心领了，我津贴比大家的高，这已经很照顾了，绝不能再搞半点特殊化！”’
李士英在生活上对干部关心体贴，政治上却严格要求，但是对犯错误的干部，也不是一棍子打死，而是晓之以理、动之以情，唤起其改正错误的认识和决心。省公安厅有一位副厅长，因违反纪律，群众影响很坏，厅党组对其进行了严厉的批评教育，并给予降职、降级处分。当时，正是供给制和工资制过渡时期，那位副厅长原来每月是50元津贴，受处分后，每月只领20元津贴，他三个孩子都在上学，妻子长年有病，生活出现困难。李士英知道后，拿出自己的30元钱，让秘书送给他。那位副厅长接到钱后，流着泪说：“请转告李厅长，我一定好好改造思想，请他放心”。
有一件事让李士英的秘书很难忘。1953年，李士英去北京开会，山东沂水县的一位老大娘找到省公安厅门口，口口声声说她的儿子叫李士英，参军后没有了音讯，这次专门来济南看儿子。秘书想，既然是李厅长的母亲来了，就应当热情接待，把老人安排在招待所吃住。李士英回来后，秘书说：“你母亲从沂水来看你了，现住在招待所。”李士英一听笑了，说：“我母亲在河南内黄老家，可能这位老人搞错了，也许是同名同姓。”秘书见此情况就要送她走，李士英说：“不，她既然说儿子参了军，解放这么多年又没找到，或许是牺牲了，战争中无名烈士多着呢，对这样一位有功于国家的老人，我们不能太简单。走，咱们看看去。”一见面，老大娘知道认错了人，很不好意思，起身要走。李士英劝她再住几天，看看济南，并拿出20元钱给老大娘作路费，老大娘不肯收，李士英动情地说：“就算儿子给母亲的吧。”老大娘只好收下。临别时，老大娘握着李士英的手，眼里闪动着感激的泪花。送走老大娘，李士英感慨地说：“干革命离不开人民群众，搞建设还得依靠人民群众，对待群众一定要热情啊”。
